在细胞生物学中,相互作用是常见的现象,尤其是在蛋白质研究中更是如此。其中,blastp即为一种广泛应用的蛋白质相互作用分析工具。
blastp是一种基于蛋白质序列的BLAST(Basic Local Alignment Search Tool)算法,并利用BLOSUM62矩阵对蛋白质进行比对,以寻找相似蛋白质序列及相互作用,可帮助研究者分析蛋白质的结构及功能。
blastp的应用广泛,目前主要用于基因组学、蛋白质质谱学及生物信息学等领域。例如,用此工具分析宿主与感染菌株之间的蛋白质相互作用关系,可帮助研究者深入了解感染机制。